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黄柏为落叶乔木，高10-25m。树皮厚，外皮灰褐色，木栓发达，不规则网状纵沟裂，内皮鲜黄色。小枝通常灰褐色或淡棕色，罕为 红棕色，有小皮孔。奇数羽状复叶对生，小叶柄短；小叶5-15枚，披针形至卵状长圆形，长3-11cm，宽1.5-4cm，先端长渐尖，叶基不等的广楔形或近圆形，边缘有细钝齿，齿缝有腺点，上面暗绿色**，下面苍白色，仅中脉基部两侧密被柔毛，薄纸质。雌雄异株；圆锥状聚伞花序，花轴及花枝幼时被毛；花小，黄绿 色；雄花雄蕊5，伸出花瓣外，花丝基部有毛；雌花的退化雄蕊呈小鳞片状；雌蕊1，子房有短柄，5室，花枝短，柱头5浅裂。浆果 状核果呈球形，直径8-10mm，密集成团，熟后紫黑色，内有种子2-5颗。花期5-6月，果期9-10月。

川黄柏：落叶乔木，高10 - 12米。树干皮暗灰棕色，幼枝皮暗棕褐色或紫棕色，皮开裂，有白色皮孔，树皮无加厚的木栓层。叶对生，奇数羽状复叶，小叶通常7- 15片，长圆形至长卵形，先端渐尖，基部平截或圆形，上面暗绿色，仅中脉被毛，下面浅绿色，有长柔毛。花单性，淡黄色，顶生圆锥花序。花瓣5-8，雄花有雄蕊5-6枚，雌花有退化雄蕊5-6枚，雌蕊1，子房上位，柱头5裂。浆果状棱果肉质，圆球形，黑色，密集成团，种子4-6，卵状长圆形或半椭圆形，褐色或黑褐色，花期5-6月，果期6-10月。